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白点虫（Ichthyophthirius multifiliis）の体表及びエラへの寄生によって起こります。
白点虫は、原生動物の繊毛虫に分類され、ゾウリムシと近縁な生物です。
白点虫の成虫は直径０．５ｍｍ程度の円形または楕円形で、その周囲は、繊毛とよばれる細かな毛で被われています。
白点虫のライフサイクルは、まず、魚体上で成熟した白点虫は、魚から離脱してシストを形成します。
このシストは、ネバネバしたゼラチン状の厚い膜で被われていますので、水槽のガラス面や砂利の上に付着します。
そして、シストは細胞分裂を繰り返しながら仔虫を放出します。
一般的に水温が高いときは、放出される仔虫の数は多くなりますが、仔虫は小さくなります。
このようにしてシストから放出された仔虫は、寄生するべき魚を求めて泳ぎ出しますが、２４時間以内に寄生できなかった仔虫は、体力を消耗して死滅します。
また魚に寄生できた仔虫は、肉眼で確認される大きさまで成長します。
白点病の進行が早いのは、魚体から離れた成熟虫がシストを形成して、仔虫を放出するまでの時間が、２４時間以内であることです。
すなわち、１個の成熟虫が２４時間以内に数千倍にも増えるからです。

原生動物のツリガネムシ（エピスティリス）が、魚の体表やヒレに着生することにより起こります。
この病気の初期に見られる白い粘質の点は、ツリガネムシがたくさん集まって着生しているものです。
ツリガネムシは長い柄で魚体に着生します。柄の先端には釣り鐘状の本体があり繊毛を運動させながら、水中の微生物などを捕食しています。そしてある条件下になると本体が柄から切り離されて、水中を自由に泳ぎまわり、他の魚に寄生してゆきます。
エピスティリス症は、病気が進行するに従い穴あき病や尾ぐされ病とよく似た症状になるので、誤診されることがありますので注意してください。診断は、患部を取って顕微鏡で観察しツリガネムシの有無を確認してください。

これらの寄生虫は、扁形動物の単性類に分類され、いずれも外部寄生性です。 ダクチロギルスはエラに寄生し、ギロダクチルスはエラ・体表・ヒレに寄生します。
この２種の寄生虫は、形態的にフックと呼ばれる鈎のようなものを用いて魚に寄生します。
また、ギロダクチルスは胎生で、体内に仔虫さらに仔虫の体内に孫虫が確認されるので、三代虫とも呼ばれています。
それに対して、ダクチロギルスは卵生です。

イカリムシ（Lernaea cyprinacea）はミジンコに近縁な甲殻類に分類されます。
魚に寄生するのはメスのみです。メスは交尾後、頭部を魚体に突き刺して寄生生活を始めます。
イカリムシの名前は、頭部の形が船のイカリのような形状をしていることに由来します。
このため一度突き刺さったイカリムシは簡単に抜けることはありません。
イカリムシのメスの寿命は、夏で１．５～２ヶ月ですが、冬の間イカリムシは、魚に突き刺さった状態で越冬します。
そして、サクラが散り始める頃よりイカリムシは越冬から目覚め、産卵を行います。
メスは一生のうち、１３～１５回も産卵を繰り返します。
卵からふ化したイカリムシの子供は、ノープリウス幼生とよばれ、ミジンコによく似た形をしています。ふ化した幼生は、脱皮しながら成長します。
イカリムシは、ふ化してすぐ魚に寄生しません。
しばらくはミジンコのように、水中を浮遊しています。
もちろんこの段階で魚に食べられることもあります。
そして４回の脱皮後、ようやく魚の体表に寄生しますが、まだこの段階でも魚に突き刺さることは無く、体表の上を自由に動き回り、脱皮を繰り返し成虫となります。
成虫となったイカリムシはやがて交尾し、オスは交尾後死に、メスは頭を魚に突き刺し寄生生活を始めます。

ウオジラミは扁平な形状をしており腹部前方にある一対の吸盤で魚に取り付きます。この寄生虫はオス・メスともに魚に寄生します。
メスは、一生で１０回程度産卵しますが、ふ化した幼生は直ちに魚を求めて泳ぎ出します。
成熟したメスは、水槽のガラス面や石等に産卵します。
この時の卵の大きさは、0.4　X　０．２５ｍｍくらいで、一度に３０～２００個の卵をゼラチン様の物質で、包み込むように、しっかりと対象物に産卵します。
ウオジラミの成長は、水温に影響されます。すなわち、ウオジラミの発育適水温は、１５～３０℃と言われていますが、この範囲内では、水温が高いほど、成長も早くなります。
例えば、孵化日数を見ますと、水温２８～３０℃では、１０．７日ですが、水温１６～１７℃では、４４日もかかります。
一般に11月ごろ産卵された卵は、水温が、発育適水温より下がるため、卵が孵化するのは、翌年の４月ごろになります。
このように、ウオジラミは、卵で、越冬するわけです。孵化した仔虫は、魚を求めて水中を遊泳します。魚に寄生しますと、そこで、脱皮を繰り返し、成虫へと成長します。

ミズカビ科に属するいろんな糸状菌（サプロレグニア）の寄生が原因です。綿状にみえる部分は菌糸体とよばれます。
この菌糸は、植物の根のように体のなかへ入り込み養分を吸収します。ミズカビ病の死因は養分を吸い取られるために魚の浸透圧調整機能が破壊されるためであると考えられています。
通常、飼育水のなかにはミズカビの種というべき遊走子が常に存在しています。
この遊走子が健康な魚に遭遇しても簡単にミズカビ病になることはありませんが、輸送中に生じたスレ傷や、細菌感染・外部寄生虫により生じた外傷に遊走子が接触すると発病することがあります。
このようにミズカビ病は二次的な病気として発生することがあります。
また魚体に寄生したミズカビの菌糸は成長するとその先端に遊走子嚢とよばれる器官が形成され、そこから遊走子が放出されることにより他の魚に感染してゆきます。

粘液滑走細菌のフラボバクテリウム　カラムナーレ（カラムナリス菌）とよばれる細菌の感染によって尾ぐされ病は起こります。
このカラムナリス菌は、魚のヒレ以外にエラや口の周囲にも感染しますので、その感染部位にちなんで、エラぐされ病や口ぐされ病とよばれていますが、原因は同じです。
尾ぐされ病の初期症状でヒレの先端が白く濁るのは、このカラムナリス菌が感染したためヒレの組織が破壊（壊死）されたためです。
またヒレが裂けるのは、カラムナリス菌が強力なタンパク質分解酵素を出してヒレを溶かしてしまうためです。
このカラムナリス菌は酸素が充分供給されないと増殖することが出来ないため、感染の範囲が内臓まで及ぶことはありません。
言い換えますと酸素が供給されやすいヒレやエラなどに感染しやすい訳です。

エロモナス ハイドロフィラ（Aeromonas hydrophila）とよばれる病原細菌の感染によって引き起こされる病気であることがわかっています。
この病原細菌は、淡水環境中では、常に存在する細菌ですが、水質の変化等で、魚がストレスを受けたときに、この細菌に対する抵抗力が低下し、病気が発生すると考えられています。
特に梅雨の時期では、雨が降った後などは、水温が急激に変化することがあるので、要注意です。また、この細菌は、比較的高水温　（２５～３０℃）で、繁殖しやすい細菌ですので、夏―秋にかけて、発生しやすい病気です。
また、池で飼育されている鯉は、水温の変化が著しい春先は、要注意です。
この時期は、越冬明けで、鯉は、病原菌に対する抵抗力が、低下していますので、これらの病原細菌に感染しやすいと言われています。